增值稅作為我國流轉稅中的主要稅種，在公平稅負的前提下，針對特殊行業和特殊商品規定了一些稅收優惠政策。在對增值稅的減免稅政策進行審計時，始終要明確的一個會計核算原則就是，納稅人兼營免稅、減稅項目的，應單獨核算免稅、減稅項目的銷售額。未單獨核算銷售額的，或者不能準確提供銷售額的，不得免稅、減稅。筆者簡單總結了以下幾種免稅政策的審計方法。
1.調閱稅務機關的收發文登記簿。
通過這一手段，一方面可以審查出地方政府或稅務機關是否存在越權免稅的問題，另一方面可以及時準確了解國家稅收政策變化的情況，把握審計的重點，也有利于發現審計線索。
2.對稅收會計報表進行審計。
通過審計“減免稅金”科目，了解免稅的總體情況，要重點核對“提退稅金明細月報表”和“減免稅金明細月報表”，重點關注免稅額度大的項目。
3.調閱相關的稅收征管資料。
在了解了增值稅免稅的總體情況后，確定審計的重點免稅項目和行業，核對減免稅批件。在核對時主要涉及兩個方面，一方面是稅收會計、統計報表數字的真實性的審計。要結合稅務機關的電子數據和企業的減免稅檔案，審計核實報表的真實性，如果存在不一致的問題，要查明原因，落實責任。另一方面是合規性審計，即稅務機關在批準免稅時是否按照國家規定，嚴格履行審批手續，是否存在越權減免的問題。
4.企業延伸審計。
在選擇需要延伸審計的企業時，應與稅務稽查相結合，挑選具有代表性、典型性的不同行業的企業。在延伸企業時，主要是實地了解生產免稅商品的企業或國家規定的免稅行業的具體生產經營情況，會計核算情況以及在工商部門的登記情況。核對企業的報表、賬冊與納稅申報的數據是否吻合。對于規定免稅范圍、比例的商品，還要重新驗證實際減免的商品范圍或比例是否符合規定，是否存在魚目混珠的現象。特別要注意兼營免稅商品的企業在會計上是否單獨核算，單獨申報納稅，否則不予免稅。
